Extract hexagonal bin centroids coordinates and the corresponding standardise counts.
Source:R/2d.R
extract_hexbin_centroids.RdExtract hexagonal bin centroids coordinates and the corresponding standardise counts.
Value
A tibble contains hexagon ID (h), centroid coordinates (c_x, c_y),
bin counts (n_h), and standardise counts (w_h).
Examples
all_centroids_df <- scurve_model_obj$hb_obj$centroids
counts_data <- scurve_model_obj$hb_obj$std_cts
extract_hexbin_centroids(centroids_data = all_centroids_df,
counts_data = counts_data)
#> h c_x c_y n_h w_h
#> 1 1 -0.1000000 -0.11568014 0 0.000
#> 2 2 -0.0165892 -0.11568014 0 0.000
#> 3 3 0.0668216 -0.11568014 0 0.000
#> 4 4 0.1502324 -0.11568014 0 0.000
#> 5 5 0.2336432 -0.11568014 0 0.000
#> 6 6 0.3170540 -0.11568014 0 0.000
#> 7 7 0.4004648 -0.11568014 0 0.000
#> 8 8 0.4838756 -0.11568014 0 0.000
#> 9 9 0.5672864 -0.11568014 0 0.000
#> 10 10 0.6506972 -0.11568014 0 0.000
#> 11 11 0.7341080 -0.11568014 0 0.000
#> 12 12 0.8175188 -0.11568014 0 0.000
#> 13 13 0.9009296 -0.11568014 0 0.000
#> 14 14 0.9843404 -0.11568014 0 0.000
#> 15 15 1.0677512 -0.11568014 0 0.000
#> 16 16 -0.0582946 -0.04344427 0 0.000
#> 17 17 0.0251162 -0.04344427 0 0.000
#> 18 18 0.1085270 -0.04344427 0 0.000
#> 19 19 0.1919378 -0.04344427 0 0.000
#> 20 20 0.2753486 -0.04344427 0 0.000
#> 21 21 0.3587594 -0.04344427 0 0.000
#> 22 22 0.4421702 -0.04344427 0 0.000
#> 23 23 0.5255810 -0.04344427 0 0.000
#> 24 24 0.6089918 -0.04344427 0 0.000
#> 25 25 0.6924026 -0.04344427 0 0.000
#> 26 26 0.7758134 -0.04344427 0 0.000
#> 27 27 0.8592242 -0.04344427 0 0.000
#> 28 28 0.9426350 -0.04344427 0 0.000
#> 29 29 1.0260458 -0.04344427 0 0.000
#> 30 30 1.1094566 -0.04344427 0 0.000
#> 31 31 -0.1000000 0.02879160 0 0.000
#> 32 32 -0.0165892 0.02879160 0 0.000
#> 33 33 0.0668216 0.02879160 0 0.000
#> 34 34 0.1502324 0.02879160 1 0.001
#> 35 35 0.2336432 0.02879160 10 0.010
#> 36 36 0.3170540 0.02879160 8 0.008
#> 37 37 0.4004648 0.02879160 8 0.008
#> 38 38 0.4838756 0.02879160 2 0.002
#> 39 39 0.5672864 0.02879160 0 0.000
#> 40 40 0.6506972 0.02879160 0 0.000
#> 41 41 0.7341080 0.02879160 2 0.002
#> 42 42 0.8175188 0.02879160 12 0.012
#> 43 43 0.9009296 0.02879160 0 0.000
#> 44 44 0.9843404 0.02879160 0 0.000
#> 45 45 1.0677512 0.02879160 0 0.000
#> 46 46 -0.0582946 0.10102747 0 0.000
#> 47 47 0.0251162 0.10102747 0 0.000
#> 48 48 0.1085270 0.10102747 0 0.000
#> 49 49 0.1919378 0.10102747 11 0.011
#> 50 50 0.2753486 0.10102747 9 0.009
#> 51 51 0.3587594 0.10102747 4 0.004
#> 52 52 0.4421702 0.10102747 11 0.011
#> 53 53 0.5255810 0.10102747 12 0.012
#> 54 54 0.6089918 0.10102747 1 0.001
#> 55 55 0.6924026 0.10102747 6 0.006
#> 56 56 0.7758134 0.10102747 12 0.012
#> 57 57 0.8592242 0.10102747 12 0.012
#> 58 58 0.9426350 0.10102747 0 0.000
#> 59 59 1.0260458 0.10102747 0 0.000
#> 60 60 1.1094566 0.10102747 0 0.000
#> 61 61 -0.1000000 0.17326335 0 0.000
#> 62 62 -0.0165892 0.17326335 0 0.000
#> 63 63 0.0668216 0.17326335 0 0.000
#> 64 64 0.1502324 0.17326335 5 0.005
#> 65 65 0.2336432 0.17326335 10 0.010
#> 66 66 0.3170540 0.17326335 10 0.010
#> 67 67 0.4004648 0.17326335 11 0.011
#> 68 68 0.4838756 0.17326335 5 0.005
#> 69 69 0.5672864 0.17326335 14 0.014
#> 70 70 0.6506972 0.17326335 11 0.011
#> 71 71 0.7341080 0.17326335 9 0.009
#> 72 72 0.8175188 0.17326335 6 0.006
#> 73 73 0.9009296 0.17326335 6 0.006
#> 74 74 0.9843404 0.17326335 0 0.000
#> 75 75 1.0677512 0.17326335 0 0.000
#> 76 76 -0.0582946 0.24549922 0 0.000
#> 77 77 0.0251162 0.24549922 0 0.000
#> 78 78 0.1085270 0.24549922 1 0.001
#> 79 79 0.1919378 0.24549922 10 0.010
#> 80 80 0.2753486 0.24549922 5 0.005
#> 81 81 0.3587594 0.24549922 8 0.008
#> 82 82 0.4421702 0.24549922 8 0.008
#> 83 83 0.5255810 0.24549922 1 0.001
#> 84 84 0.6089918 0.24549922 9 0.009
#> 85 85 0.6924026 0.24549922 5 0.005
#> 86 86 0.7758134 0.24549922 11 0.011
#> 87 87 0.8592242 0.24549922 7 0.007
#> 88 88 0.9426350 0.24549922 9 0.009
#> 89 89 1.0260458 0.24549922 0 0.000
#> 90 90 1.1094566 0.24549922 0 0.000
#> 91 91 -0.1000000 0.31773509 0 0.000
#> 92 92 -0.0165892 0.31773509 0 0.000
#> 93 93 0.0668216 0.31773509 0 0.000
#> 94 94 0.1502324 0.31773509 11 0.011
#> 95 95 0.2336432 0.31773509 5 0.005
#> 96 96 0.3170540 0.31773509 10 0.010
#> 97 97 0.4004648 0.31773509 8 0.008
#> 98 98 0.4838756 0.31773509 0 0.000
#> 99 99 0.5672864 0.31773509 0 0.000
#> 100 100 0.6506972 0.31773509 10 0.010
#> 101 101 0.7341080 0.31773509 12 0.012
#> 102 102 0.8175188 0.31773509 2 0.002
#> 103 103 0.9009296 0.31773509 13 0.013
#> 104 104 0.9843404 0.31773509 1 0.001
#> 105 105 1.0677512 0.31773509 0 0.000
#> 106 106 -0.0582946 0.38997096 0 0.000
#> 107 107 0.0251162 0.38997096 0 0.000
#> 108 108 0.1085270 0.38997096 0 0.000
#> 109 109 0.1919378 0.38997096 9 0.009
#> 110 110 0.2753486 0.38997096 3 0.003
#> 111 111 0.3587594 0.38997096 2 0.002
#> 112 112 0.4421702 0.38997096 0 0.000
#> 113 113 0.5255810 0.38997096 0 0.000
#> 114 114 0.6089918 0.38997096 0 0.000
#> 115 115 0.6924026 0.38997096 6 0.006
#> 116 116 0.7758134 0.38997096 9 0.009
#> 117 117 0.8592242 0.38997096 10 0.010
#> 118 118 0.9426350 0.38997096 7 0.007
#> 119 119 1.0260458 0.38997096 0 0.000
#> 120 120 1.1094566 0.38997096 0 0.000
#> 121 121 -0.1000000 0.46220683 0 0.000
#> 122 122 -0.0165892 0.46220683 0 0.000
#> 123 123 0.0668216 0.46220683 0 0.000
#> 124 124 0.1502324 0.46220683 0 0.000
#> 125 125 0.2336432 0.46220683 0 0.000
#> 126 126 0.3170540 0.46220683 0 0.000
#> 127 127 0.4004648 0.46220683 0 0.000
#> 128 128 0.4838756 0.46220683 0 0.000
#> 129 129 0.5672864 0.46220683 0 0.000
#> 130 130 0.6506972 0.46220683 5 0.005
#> 131 131 0.7341080 0.46220683 12 0.012
#> 132 132 0.8175188 0.46220683 6 0.006
#> 133 133 0.9009296 0.46220683 6 0.006
#> 134 134 0.9843404 0.46220683 9 0.009
#> 135 135 1.0677512 0.46220683 0 0.000
#> 136 136 -0.0582946 0.53444270 0 0.000
#> 137 137 0.0251162 0.53444270 0 0.000
#> 138 138 0.1085270 0.53444270 0 0.000
#> 139 139 0.1919378 0.53444270 0 0.000
#> 140 140 0.2753486 0.53444270 0 0.000
#> 141 141 0.3587594 0.53444270 0 0.000
#> 142 142 0.4421702 0.53444270 0 0.000
#> 143 143 0.5255810 0.53444270 0 0.000
#> 144 144 0.6089918 0.53444270 0 0.000
#> 145 145 0.6924026 0.53444270 9 0.009
#> 146 146 0.7758134 0.53444270 9 0.009
#> 147 147 0.8592242 0.53444270 6 0.006
#> 148 148 0.9426350 0.53444270 6 0.006
#> 149 149 1.0260458 0.53444270 1 0.001
#> 150 150 1.1094566 0.53444270 0 0.000
#> 151 151 -0.1000000 0.60667858 0 0.000
#> 152 152 -0.0165892 0.60667858 0 0.000
#> 153 153 0.0668216 0.60667858 0 0.000
#> 154 154 0.1502324 0.60667858 0 0.000
#> 155 155 0.2336432 0.60667858 0 0.000
#> 156 156 0.3170540 0.60667858 0 0.000
#> 157 157 0.4004648 0.60667858 0 0.000
#> 158 158 0.4838756 0.60667858 0 0.000
#> 159 159 0.5672864 0.60667858 0 0.000
#> 160 160 0.6506972 0.60667858 10 0.010
#> 161 161 0.7341080 0.60667858 9 0.009
#> 162 162 0.8175188 0.60667858 5 0.005
#> 163 163 0.9009296 0.60667858 5 0.005
#> 164 164 0.9843404 0.60667858 8 0.008
#> 165 165 1.0677512 0.60667858 0 0.000
#> 166 166 -0.0582946 0.67891445 0 0.000
#> 167 167 0.0251162 0.67891445 0 0.000
#> 168 168 0.1085270 0.67891445 0 0.000
#> 169 169 0.1919378 0.67891445 0 0.000
#> 170 170 0.2753486 0.67891445 0 0.000
#> 171 171 0.3587594 0.67891445 0 0.000
#> 172 172 0.4421702 0.67891445 0 0.000
#> 173 173 0.5255810 0.67891445 1 0.001
#> 174 174 0.6089918 0.67891445 10 0.010
#> 175 175 0.6924026 0.67891445 9 0.009
#> 176 176 0.7758134 0.67891445 6 0.006
#> 177 177 0.8592242 0.67891445 11 0.011
#> 178 178 0.9426350 0.67891445 5 0.005
#> 179 179 1.0260458 0.67891445 0 0.000
#> 180 180 1.1094566 0.67891445 0 0.000
#> 181 181 -0.1000000 0.75115032 0 0.000
#> 182 182 -0.0165892 0.75115032 0 0.000
#> 183 183 0.0668216 0.75115032 0 0.000
#> 184 184 0.1502324 0.75115032 3 0.003
#> 185 185 0.2336432 0.75115032 5 0.005
#> 186 186 0.3170540 0.75115032 3 0.003
#> 187 187 0.4004648 0.75115032 11 0.011
#> 188 188 0.4838756 0.75115032 3 0.003
#> 189 189 0.5672864 0.75115032 12 0.012
#> 190 190 0.6506972 0.75115032 6 0.006
#> 191 191 0.7341080 0.75115032 5 0.005
#> 192 192 0.8175188 0.75115032 8 0.008
#> 193 193 0.9009296 0.75115032 9 0.009
#> 194 194 0.9843404 0.75115032 0 0.000
#> 195 195 1.0677512 0.75115032 0 0.000
#> 196 196 -0.0582946 0.82338619 0 0.000
#> 197 197 0.0251162 0.82338619 12 0.012
#> 198 198 0.1085270 0.82338619 9 0.009
#> 199 199 0.1919378 0.82338619 10 0.010
#> 200 200 0.2753486 0.82338619 11 0.011
#> 201 201 0.3587594 0.82338619 9 0.009
#> 202 202 0.4421702 0.82338619 12 0.012
#> 203 203 0.5255810 0.82338619 7 0.007
#> 204 204 0.6089918 0.82338619 8 0.008
#> 205 205 0.6924026 0.82338619 11 0.011
#> 206 206 0.7758134 0.82338619 5 0.005
#> 207 207 0.8592242 0.82338619 7 0.007
#> 208 208 0.9426350 0.82338619 0 0.000
#> 209 209 1.0260458 0.82338619 0 0.000
#> 210 210 1.1094566 0.82338619 0 0.000
#> 211 211 -0.1000000 0.89562206 0 0.000
#> 212 212 -0.0165892 0.89562206 4 0.004
#> 213 213 0.0668216 0.89562206 8 0.008
#> 214 214 0.1502324 0.89562206 5 0.005
#> 215 215 0.2336432 0.89562206 8 0.008
#> 216 216 0.3170540 0.89562206 8 0.008
#> 217 217 0.4004648 0.89562206 4 0.004
#> 218 218 0.4838756 0.89562206 9 0.009
#> 219 219 0.5672864 0.89562206 7 0.007
#> 220 220 0.6506972 0.89562206 10 0.010
#> 221 221 0.7341080 0.89562206 7 0.007
#> 222 222 0.8175188 0.89562206 15 0.015
#> 223 223 0.9009296 0.89562206 0 0.000
#> 224 224 0.9843404 0.89562206 0 0.000
#> 225 225 1.0677512 0.89562206 0 0.000
#> 226 226 -0.0582946 0.96785794 0 0.000
#> 227 227 0.0251162 0.96785794 12 0.012
#> 228 228 0.1085270 0.96785794 6 0.006
#> 229 229 0.1919378 0.96785794 5 0.005
#> 230 230 0.2753486 0.96785794 5 0.005
#> 231 231 0.3587594 0.96785794 7 0.007
#> 232 232 0.4421702 0.96785794 14 0.014
#> 233 233 0.5255810 0.96785794 3 0.003
#> 234 234 0.6089918 0.96785794 3 0.003
#> 235 235 0.6924026 0.96785794 8 0.008
#> 236 236 0.7758134 0.96785794 7 0.007
#> 237 237 0.8592242 0.96785794 0 0.000
#> 238 238 0.9426350 0.96785794 0 0.000
#> 239 239 1.0260458 0.96785794 0 0.000
#> 240 240 1.1094566 0.96785794 0 0.000
#> 241 241 -0.1000000 1.04009381 0 0.000
#> 242 242 -0.0165892 1.04009381 4 0.004
#> 243 243 0.0668216 1.04009381 9 0.009
#> 244 244 0.1502324 1.04009381 9 0.009
#> 245 245 0.2336432 1.04009381 5 0.005
#> 246 246 0.3170540 1.04009381 8 0.008
#> 247 247 0.4004648 1.04009381 8 0.008
#> 248 248 0.4838756 1.04009381 7 0.007
#> 249 249 0.5672864 1.04009381 5 0.005
#> 250 250 0.6506972 1.04009381 4 0.004
#> 251 251 0.7341080 1.04009381 0 0.000
#> 252 252 0.8175188 1.04009381 0 0.000
#> 253 253 0.9009296 1.04009381 0 0.000
#> 254 254 0.9843404 1.04009381 0 0.000
#> 255 255 1.0677512 1.04009381 0 0.000
#> 256 256 -0.0582946 1.11232968 0 0.000
#> 257 257 0.0251162 1.11232968 4 0.004
#> 258 258 0.1085270 1.11232968 13 0.013
#> 259 259 0.1919378 1.11232968 14 0.014
#> 260 260 0.2753486 1.11232968 6 0.006
#> 261 261 0.3587594 1.11232968 7 0.007
#> 262 262 0.4421702 1.11232968 10 0.010
#> 263 263 0.5255810 1.11232968 10 0.010
#> 264 264 0.6089918 1.11232968 0 0.000
#> 265 265 0.6924026 1.11232968 0 0.000
#> 266 266 0.7758134 1.11232968 0 0.000
#> 267 267 0.8592242 1.11232968 0 0.000
#> 268 268 0.9426350 1.11232968 0 0.000
#> 269 269 1.0260458 1.11232968 0 0.000
#> 270 270 1.1094566 1.11232968 0 0.000
#> 271 271 -0.1000000 1.18456555 0 0.000
#> 272 272 -0.0165892 1.18456555 0 0.000
#> 273 273 0.0668216 1.18456555 3 0.003
#> 274 274 0.1502324 1.18456555 1 0.001
#> 275 275 0.2336432 1.18456555 2 0.002
#> 276 276 0.3170540 1.18456555 1 0.001
#> 277 277 0.4004648 1.18456555 1 0.001
#> 278 278 0.4838756 1.18456555 0 0.000
#> 279 279 0.5672864 1.18456555 0 0.000
#> 280 280 0.6506972 1.18456555 0 0.000
#> 281 281 0.7341080 1.18456555 0 0.000
#> 282 282 0.8175188 1.18456555 0 0.000
#> 283 283 0.9009296 1.18456555 0 0.000
#> 284 284 0.9843404 1.18456555 0 0.000
#> 285 285 1.0677512 1.18456555 0 0.000
#> 286 286 -0.0582946 1.25680142 0 0.000
#> 287 287 0.0251162 1.25680142 0 0.000
#> 288 288 0.1085270 1.25680142 0 0.000
#> 289 289 0.1919378 1.25680142 0 0.000
#> 290 290 0.2753486 1.25680142 0 0.000
#> 291 291 0.3587594 1.25680142 0 0.000
#> 292 292 0.4421702 1.25680142 0 0.000
#> 293 293 0.5255810 1.25680142 0 0.000
#> 294 294 0.6089918 1.25680142 0 0.000
#> 295 295 0.6924026 1.25680142 0 0.000
#> 296 296 0.7758134 1.25680142 0 0.000
#> 297 297 0.8592242 1.25680142 0 0.000
#> 298 298 0.9426350 1.25680142 0 0.000
#> 299 299 1.0260458 1.25680142 0 0.000
#> 300 300 1.1094566 1.25680142 0 0.000